生物信息學(xué)服務(wù)
技術(shù)簡介
生物信息服務(wù)
生物信息學(xué)是一門隨著生物學(xué)的發(fā)展特別是系統(tǒng)生物學(xué)的發(fā)展而發(fā)展的科學(xué),為后基因組時代的研究提供了更快、更新、更準(zhǔn)確的研究手段。準(zhǔn)確可靠的生物信息學(xué)統(tǒng)計與分析結(jié)果有助于研究者全面了解基因的功能信息,為后續(xù)的深入研究提供了方向,同時也是取得有說服力的研究成果的關(guān)鍵因素之一。
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◆預(yù)后分子分型分析;
◆Biomaker分析;
◆多組學(xué)分析;
◆藥物靶點的預(yù)測;
◆基因動態(tài)分析;
◆公共數(shù)據(jù)挖掘;
◆RNA、DNA標(biāo)準(zhǔn)化分析。
技術(shù)細(xì)節(jié)
1. 預(yù)后分子分型分析
通過分析癌癥樣本中的基因信息(表達(dá)、甲基化等)以及臨床信息,使用多種分類器挖掘預(yù)后相關(guān)標(biāo)志物,為癌癥的預(yù)后提供有效的預(yù)測模型。
2.Biomarker分析
通過分析腫瘤和正常樣本的基因信息(表達(dá)、甲基化等),使用分子建模的方法,發(fā)現(xiàn)早期診斷標(biāo)志物。
- 多組學(xué)分析
多組學(xué)分析是癌癥研究的重要手段,整合DNA、RNA等不同層面的數(shù)據(jù)分析,可以更加全面的了解腫瘤進(jìn)化過程中的分子特征,為研究其調(diào)控機制提供綜合解決方案。 - 藥物靶點預(yù)測
根據(jù)用藥前后基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的變化情況,找出潛在的藥物靶點,從而揭示藥物作用的機制。 - 基于動態(tài)分析
根據(jù)樣本的基因和臨床信息(例如癌癥分期,時間動態(tài)變化,空間動態(tài)變化等),用SOM-SVD方法篩選出與之相關(guān)的特征基因,從而將特定分子基因集合特定臨床表型聯(lián)系起來,作為臨床診斷和預(yù)后標(biāo)志物提供依據(jù)。 - 公共數(shù)據(jù)挖掘
市面上有著眾多的數(shù)據(jù)庫可供利用,例如TCGA、GEO,蘊含著眾多層面的疾病數(shù)據(jù)。
根據(jù)客戶需求,整理特定層面數(shù)據(jù),包括miRNA,mRNA,甲基化,臨床數(shù)據(jù)等??梢糟暯硬町惡Y選、功能富集、靶基因預(yù)測、網(wǎng)絡(luò)分析、生存分析、分子標(biāo)志物分析等多種生物信息學(xué)分析內(nèi)容,為用戶研究疾病的發(fā)生發(fā)展機制提供理論基礎(chǔ)。
本產(chǎn)品由于其獨特的性質(zhì),具有高度的定制性。具體的工作內(nèi)容與客戶的具體目標(biāo)和需求直接相關(guān)。
- DNA、RNA標(biāo)準(zhǔn)化分析
將常規(guī)的生物信息學(xué)分析內(nèi)容進(jìn)行組合使之標(biāo)準(zhǔn)化、模塊化,簡化了生物信息學(xué)分析的步驟,降低了分析的復(fù)雜度。包括mRNA、lncRNA、miRNA、circRNA標(biāo)準(zhǔn)分析、表達(dá)譜芯片標(biāo)準(zhǔn)分析、miRNA芯片標(biāo)準(zhǔn)分析、甲基化芯片標(biāo)準(zhǔn)分析、全基因組測序標(biāo)準(zhǔn)分析、全外顯子組測序標(biāo)準(zhǔn)分析。