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細胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single cell RNA sequencing），是在單個細胞水平對mRNA進行高通量測序的一項新技術(shù)，針對單個細胞研究其整體水平的基因表達情況，成功解決細胞分子機制研究中常見的細胞異質(zhì)性、細胞量少而無法進行常規(guī)高通量測序等難題。

單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)主要用于在全基因組范圍內(nèi)挖掘基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，尤其適用于存在高度異質(zhì)性的干細胞、腫瘤細胞及胚胎發(fā)育早期的細胞群體。單細胞轉(zhuǎn)錄組分析有助于深入理解細胞分化、細胞重編程及轉(zhuǎn)分化等過程及相關(guān)的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。