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簡化基因組測序
(Reduced-Representation Genome Sequencing，RRGS)

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技術待認領

技術概述

簡化基因組測序（Reduced-Representation Genome Sequencing，RRGS）是指利用限制性內切酶打斷基因組DNA，對特定片段進行高通量測序獲得海量遺傳多態(tài)性標簽序列來充分代表目標物種全基因組信息的測序策略。此方法實驗步驟簡單，成本低，而且可以不依賴參考基因組，就能獲得全基因組范圍內的遺傳多態(tài)性標簽，因而廣泛應用于生態(tài)學，進化學和基因組學等領域。

簡化基因組能獲得全基因組范圍內有代表性的遺傳多樣性位點，因而廣泛應用于群體進化、群體結構、種群歷史、遺傳定位和連鎖圖譜的構建。

（資料來源：派森諾生物）

技術詳情

主要的簡化基因組檢測技術

到目前為止，科學家已經(jīng)開發(fā)出了多種簡化基因組的技術。其中，使用得比較多的技術主要有四種：即經(jīng)典的 RAD、經(jīng)典的 GBS、2bRAD、 ddGBS（也就是ddRAD）。這四種方法的建庫流程見下圖。

（派森諾生物編輯）

SLAF-seq技術：大規(guī)模基因分型高通量策略

大規(guī)?；蚍中驮谶z傳相關性研究中起著重要作用，尤其是和高通量測序技術結合后，它為基因挖掘帶來了新的機遇。大規(guī)?；蚍中偷挠行Ы鉀Q方法：SLAF-seq（specific-locus amplified fragment sequencing），該技術前期利用生物信息學方法，對目標物種的參考基因組（或已知BAC序列）進行系統(tǒng)分析，設計標記開發(fā)方案，后期根據(jù)前期的方案，構建SLAF-seq文庫，篩選特異性長度片段進行高通量測序，將獲得測序深度和質量滿足要求的SLAF片段來代表目標物種的全基因組信息。它具有以下優(yōu)勢:

1. 高深度測序保證分型準確；
2. 簡化的策略降低測序成本；
3. 前期簡化方案預測保障標記數(shù)量最優(yōu)；
4. 采用double index技術能適用于大群體。

（SLAF簡化基因組測序）

簡化基因組檢測方法的主要特點