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small RNA測序
（small rna sequencing ）

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技術(shù)待認(rèn)領(lǐng)

技術(shù)概述

Small RNA（包括miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等）是一大類調(diào)控分子，幾乎存在于所有的生物體中。

Small RNA通過mRNA降解、翻譯抑制、異染色質(zhì)形成以及DNA去除等作用途徑，在基因表達(dá)調(diào)控、生物個體發(fā)育、代謝紊亂及疾病發(fā)生和發(fā)展等生理過程中發(fā)揮重要作用。miRNA 是一類內(nèi)源性的、長度約 18-25 nt、具有調(diào)控功能的非編碼 RNA，通過和靶基因堿基配對引導(dǎo)沉默復(fù)合體降解 mRNA 或阻礙其翻譯。Small RNA 測序技術(shù)不受物種限制，既能鑒定特定條件下表達(dá)的 miRNA，又能預(yù)測發(fā)現(xiàn)新的 miRNA，對于疾病的發(fā)生發(fā)展研究有重要意義。

（資料來源：歐易生物）

技術(shù)詳情

1、small RNA 測序后進(jìn)行 RT-PCR 驗證時，常會出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增，如何解決？

因為 miRNA 序列比較短，彼此間相似度又非常高，尤其是同一家族的 miRNAs，彼此間可能只有 1 個堿基差異，出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增是很正常的，建議使用 Taqman 探針法進(jìn)行嘗試。

（歐易生物編輯）

2、沒有參考基因組可否進(jìn)行 small RNA 測序

進(jìn)行生物信息分析時，針對有參考基因組樣本，以該物種的基因組以及該物種的 miRBase 數(shù)據(jù)庫為參照進(jìn)行數(shù)據(jù)分析；如果沒有參考基因組，可以近緣物種的基因組以及近緣物種的 miRBase 數(shù)據(jù)庫為參考，或者動物樣本以所有動物的 miRBase 數(shù)據(jù)庫、植物樣本以所以植物的 miRBase 數(shù)據(jù)庫為參照進(jìn)行比對分析。

（歐易生物編輯）

3、 small RNA 測序?qū)颖居惺裁刺厥庖?/a>

為防止 small RNA 丟失，浪費(fèi)樣本、時間和精力，抽提 total RNA 時請使用 miRNA Homogenate Additive。如果同一份樣本同時檢測 mRNA/lncRNA 和 small RNA，請事先告知該區(qū)域負(fù)責(zé)的銷售工程師，請公司抽提人員注意保留 small RNA。

（歐易生物編輯）

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