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全基因合成 (Gene synthesis) 即基因人工合成,是重要的基因獲取手段之一，是指利用生物化學(xué)的方法將人工合成的寡核苷酸拼接成基因的一種技術(shù)?；蚝铣傻脑鲜枪押塑账?，所以人工合成的基因序列不受模板的限制。

基因化學(xué)合成使合成任何基因序列成為可能。如果說基因是生命軟件, 基因合成就是編寫生命程序, 這是與傳統(tǒng)的基因克隆技術(shù)不同的地方,后者是直接拷貝自然界已有的程序,自然受限很多?；蚧瘜W(xué)合成雖然不像PCR那樣能實現(xiàn)迅速高效的擴增，但卻有著不需要模板，直接面向序列等無法替代的優(yōu)勢。

全基因合成通常伴隨著密碼子優(yōu)化。

功能蛋白的外源宿主表達是現(xiàn)代生物技術(shù)的基礎(chǔ)，然而很多蛋白由于可能包含有抑制表達的因子：如有機體使用了不常用的密碼子等，在外源宿主中很難表達。日益發(fā)展的基因設(shè)計與合成技術(shù)使通過基因設(shè)計改善蛋白表達成為可能，例如，可以通過基因設(shè)計使基因與宿主的密碼子使用頻率相匹配來提高蛋白表達水平。密碼子優(yōu)化不僅包括密碼子優(yōu)化，還可以包括mRNA結(jié)構(gòu)修正、翻譯起始位點的優(yōu)化等。