dsRNA(double-stranded RNA),雙鏈RNA在細胞內(nèi)誘導同源序列的基因表達受抑的現(xiàn)象稱為RNA干擾。
dsRNA 可以通過注射、電穿孔和化學試劑介導的轉(zhuǎn)染等方式介入動物和細胞內(nèi)。dsRNA的制備是實施RNAi較為關鍵的一步。目前常用的dsRNA制備方法主要有2 種:體外轉(zhuǎn)錄法和體內(nèi)載體表達法。其中體外轉(zhuǎn)錄法合成dsRNA可以在預期的PCR產(chǎn)物兩端連上轉(zhuǎn)錄起始點(如T7、SP6等),先用RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄合成單鏈RNA, 再互補成dsRNA。
相比而言,要制備大量的dsRNA,采用體內(nèi)載體表達法即構建質(zhì)粒,在細菌體內(nèi)表達更為經(jīng)濟高效。帶有發(fā)夾環(huán)的dsRNA包括2個反向互補的靶序列片段,中間插入一個單鏈環(huán)。通常構建這樣的DNA模板,需要3步連接(3步克隆法)實現(xiàn),這種方法操作較為繁瑣。
長鏈dsRNA設計合成流程:
1. 通過數(shù)據(jù)庫同源比對方法選取合適的目的基因序列
2. 目的基因序列的克隆
3. 向目的基因上加入接頭,可使用的接頭有T7,T3,SP6。
4. 體外反轉(zhuǎn)錄及雙鏈RNA退火。
5. 測定濃度。
(資料來源:梁艷[1])