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MRM/PRM蛋白靶向定量
(MRM/PRM target quantitative analysis )
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技術(shù)待認(rèn)領(lǐng)

技術(shù)概述

基因的產(chǎn)物——蛋白質(zhì),反應(yīng)了生命活動正在發(fā)生的事情。蛋白質(zhì)組成及含量變化的研究愈演愈烈。在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中,一方面,WB、ELISA這些依賴于抗體的檢測方法,對抗體質(zhì)量要求極高。另一方面,基因水平的表達(dá)與蛋白含量的變化相關(guān)性較差。這些傳統(tǒng)的方法都給蛋白含量的分析帶來了困難。在這個大時代背景之下,MRM/PRM堪稱“質(zhì)譜界的WB、定量金標(biāo)準(zhǔn) 、U盤中的‘?dāng)?shù)字化抗體’”便應(yīng)運而生。

MRM/PRM簡介

PRM(平行反應(yīng)監(jiān)測, Parallel Reaction Monitoring),靶向蛋白質(zhì)組,是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的靶向定量技術(shù),能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)/肽段(以及含有修飾的肽段)進(jìn)行選擇性檢測,從而實現(xiàn)對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段的精準(zhǔn)定量。借用聽來的一個比喻來說,靶向蛋白質(zhì)組掃描就像精準(zhǔn)狙擊,排除干擾,目標(biāo)明確,每一槍直指目標(biāo)。

其基本原理是:四級桿(Q)首先選出的目標(biāo)肽段離子,進(jìn)入碰撞室中打碎后,所有的碎片離子經(jīng)過質(zhì)量分析器產(chǎn)生一張高分辨的二級質(zhì)譜圖,通過提取其中的碎片離子信息即可實現(xiàn)目標(biāo)肽段的定量。

MRM/PRM技術(shù)特點

(1)靈敏度、重現(xiàn)性和準(zhǔn)確度高,定量范圍可達(dá)到5個數(shù)量級,定量重現(xiàn)性CV<10%, 相對誤差<15%。
(2)與經(jīng)典的Westernblot、ELISA 技術(shù)相比,不需要使用抗體,獲得更為準(zhǔn)確和重現(xiàn)的定量驗證結(jié)果。
(3)在一個小時檢測時間內(nèi)可同時實現(xiàn)50個蛋白質(zhì)的定量檢測。
(4)MRM/PRM可直接檢測二級所有離子,減少了子離子的挑選和優(yōu)化過程。

MRM/PRM應(yīng)用范圍

目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段相對或絕對定量,蛋白質(zhì)翻譯后修飾的定性定量研究。
(1)定量蛋白質(zhì)組學(xué)(iTRAQ、label-free、SILAC)后,目標(biāo)蛋白需驗證
(2)要做WB,卻苦于沒有抗體
(3)有多個蛋白質(zhì)需同時定量
(4)功能研究中涉及到蛋白質(zhì)定量

在應(yīng)用時,一方面,使蛋白質(zhì)驗證不再受制于商業(yè)化抗體,可以應(yīng)用于多種非模式生物。另一方面,使抗體驗證能夠高通量的在大規(guī)模生物樣本上進(jìn)行,提高實驗效率[1]

(資料來源:金開瑞)

技術(shù)詳情

(資料來源:金開瑞)

參考文獻(xiàn)

[[1]] Chen I H , Xue L , Hsu C C , et al. Phosphoproteins in extracellular vesicles as candidate markers for breast cancer[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(12):3175-3180.

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