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靶向代謝組學(xué)（Targeted Metabolomics）是代謝組學(xué)研究的重要組成部分，也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言，靶向代謝組分析具有特異性強，檢測靈敏度高和定量準確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準確定量定性分析，一方面可以結(jié)合其它實驗數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機制，另一方面，也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。

靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM)，或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度，在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強的原因是延長了所選擇離子的采集時間。因為監(jiān)測的是一個很小的質(zhì)量窗口，所以質(zhì)量色譜圖只代表對極為特定質(zhì)量的檢測。在大多數(shù)情況下，靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進行質(zhì)譜定量的選擇方法，與 SIM 相比更為靈敏、更加特異?？梢援a(chǎn)生獨特的碎片離子，可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進行監(jiān)測和定量。