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全基因組重測(cè)序
(re-sequencing)
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技術(shù)待認(rèn)領(lǐng)

技術(shù)概述

全基因組重測(cè)序是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行不同個(gè)體的基因組測(cè)序,并在此基礎(chǔ)上對(duì)個(gè)體或群體進(jìn)行差異性分析。全基因組重測(cè)序的個(gè)體,通過序列比對(duì),可以找到大量的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP),插入缺失位點(diǎn)(InDel,Insertion/Deletion)、結(jié)構(gòu)變異位點(diǎn)(SV,Structure Variation)位點(diǎn)和拷貝數(shù)變異位點(diǎn)(CNV,copy number variation)。SBC可以協(xié)助客戶,通過生物信息手段,分析不同個(gè)體基因組間的結(jié)構(gòu)差異, 同時(shí)完成注釋。

(資料來源:百度百科)

技術(shù)詳情

一般情況下,推薦30×基因組大小的測(cè)序深度,如果基因組的復(fù)雜程度較高或?qū)NP有較高的準(zhǔn)確率要求,會(huì)適當(dāng)加深測(cè)序深度。

(歐易生物編輯)

重測(cè)序一般可以檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性(SNP)、插入缺失(InDel)、拷貝數(shù)變異(CNV)、染色體結(jié)構(gòu)變異(SV)等。

(歐易生物編輯)

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