環(huán)狀RNA(circRNA)是區(qū)別線性RNA的一類新型RNA,結(jié)構(gòu)為環(huán)狀,大量存在于真核轉(zhuǎn)錄組中。大部分的環(huán)狀RNA是由外顯子序列構(gòu)成,在不同的物種中具有保守性,同時存在組織及不同發(fā)育階段的表達(dá)特異性。
由于環(huán)狀RNA對核酸酶不敏感,比線性RNA更為穩(wěn)定,使其在作為新型臨床診斷標(biāo)記物的開發(fā)應(yīng)用上具有明顯優(yōu)勢近來已成為新的熱點(diǎn)。環(huán)狀RNA有其獨(dú)特的特點(diǎn),其閉環(huán)結(jié)構(gòu)導(dǎo)致引物設(shè)計的規(guī)則與傳統(tǒng)大有不同,同時在表達(dá)檢測的條件上也需要多次摸索。circRNA的環(huán)狀結(jié)構(gòu)經(jīng)過不同的可變剪切形成。設(shè)計逆轉(zhuǎn)錄引物時,根據(jù)其反向剪切位點(diǎn)的周圍序列進(jìn)行設(shè)計。該引物只能逆轉(zhuǎn)錄出環(huán)狀RNA,而不能逆轉(zhuǎn)錄出包含反向剪切位點(diǎn)序列的線性RNA。成功逆轉(zhuǎn)錄后,可根據(jù)序列特點(diǎn)設(shè)計相應(yīng)的通用引物和特異性TaqMan探針對其進(jìn)行熒光定量。

(資料來源:MedSci)