凝膠阻滯或電泳遷移率實(shí)驗(yàn)(Electrophoretic mobility shift assay,EMSA)是一種研究DNA結(jié)合蛋白質(zhì)和相關(guān)的DNA結(jié)合序列相互作用的技術(shù),可用于定性和定量分析。是檢測(cè)蛋白質(zhì)與DNA的相互作用的常用技術(shù),可用于分析轉(zhuǎn)錄因子、DNA修飾蛋白等與目標(biāo)DNA片段的結(jié)合。
基于DNA-蛋白質(zhì)或RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體在聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)中有不同遷移率的原理,依據(jù)實(shí)驗(yàn)需要,設(shè)計(jì)標(biāo)記探針、非標(biāo)記探針、蛋白特異性抗體等參照物,當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)(轉(zhuǎn)錄因子)與特異的DNA或RNA結(jié)合后,其在PAGE中的遷移率將小于未結(jié)合蛋白質(zhì)的DNA或RNA,從而檢測(cè)到活化的與DNA或RNA結(jié)合的蛋白轉(zhuǎn)錄或調(diào)節(jié)因子。
這一技術(shù)最初用于研究DNA結(jié)合蛋白質(zhì),目前已用于研究RNA結(jié)合蛋白質(zhì)和特定的RNA序列的相互作用。競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)中采用含蛋白質(zhì)結(jié)合序列的DNA或RNA探針,和其它相關(guān)的探針,來確定它們相互作用的特異性及強(qiáng)度。

(資料來源:百奧斯生物,聚生物整理)