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RNA/DNA pull down是研究體外條件下RNA或DNA與蛋白互作的重要技術(shù)。該技術(shù)通過體外轉(zhuǎn)錄目的RNA的一部分或全長，用生物素標記轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物，再與鏈霉親和素磁珠孵育使之固定在磁珠上，用以“pull down”互作蛋白，純化的產(chǎn)物蛋白經(jīng)特定抗體的western-blot實驗，可驗證某種蛋白與目的RNA/DNA是否有相互作用；純化的蛋白經(jīng)質(zhì)譜鑒定，即可篩選到與目的RNA結(jié)合的蛋白。

圖1 RNA-Protein Pull-Down Protocol（圖片來源：Thermo Fisher Scientific）