RNA純化的染色質(zhì)分離技術(shù)(Chromatin Isolation by RNA Purification,ChIRP)是一種檢測(cè)與RNA綁定的DNA和蛋白的高通量檢測(cè)方法。
其方法是通過(guò)設(shè)計(jì)生物素標(biāo)記RNA互補(bǔ)探針,其與鏈霉親和素結(jié)合,將目標(biāo)RNA特異性結(jié)合的同時(shí),特異性捕獲RNA結(jié)合調(diào)控的DNA染色體片段及參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的RNA結(jié)合蛋白質(zhì)(RBPs)。
?①DNA染色體片段經(jīng)過(guò)構(gòu)建文庫(kù)及高通量測(cè)序,可以基因組水平獲得轉(zhuǎn)錄調(diào)控RNA(增強(qiáng)子RNA,eRNA)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的下游靶基因,結(jié)合qPCR可以研究結(jié)合調(diào)控強(qiáng)度;
②RNA結(jié)合蛋白經(jīng)過(guò)酶消化及高效液相-質(zhì)譜分析,可以鑒定參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控的蛋白質(zhì),結(jié)合western blot可以進(jìn)一步研究結(jié)合作用強(qiáng)度。

(資料來(lái)源:伯信生物)
染色質(zhì)免疫沉淀 分離出來(lái)的DNA序列怎么設(shè)計(jì)引物PCR..