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原位雜交（in situ hybridization）將標(biāo)記的核酸探針與細(xì)胞或組織中的核酸進(jìn)行雜交，來檢測與其互補的另一條鏈在細(xì)菌或其他真核細(xì)胞中的位置。

原位雜交，或RNA原位核酸雜交（RNA nucleic acid hybridization in situ），又稱RNA原位雜交組織化學(xué)(RNA in situ hybridization histochemistry )或RNA原位雜交(RNA in situ hybridization, RISH)。該技術(shù)是指以標(biāo)記的核酸分子為探針，在組織細(xì)胞原位檢測特異核酸分子的技術(shù)。

原位雜交技術(shù)是指以標(biāo)記的核酸分子為探針，在組織細(xì)胞原位檢測特異核酸分子的技術(shù)。使含有特異序列、經(jīng)過標(biāo)記的核酸單鏈即探針，在適宜條件下與組織細(xì)胞中的互補核酸單鏈即靶核酸發(fā)生雜交，再以放射自顯影或免疫細(xì)胞化學(xué)方法對標(biāo)記探針進(jìn)行探測，從而在細(xì)胞原位顯示特異的DNA或RNA分子。可以檢測 cRNA、miRNA、LnRNA、DNA。可以各種種屬的標(biāo)本，包括哺乳動物、爬行動物、菌、植物標(biāo)本。也可以檢測組織芯片。

FISH是原位雜交技術(shù)大家族中的一員，因其所用探針被熒光物質(zhì)標(biāo)記（間接或直接）而得名，該方法在80年代末 被發(fā)明，現(xiàn)已從實驗室逐步進(jìn)入臨床診斷領(lǐng)域?；驹硎菬晒鈽?biāo)記的核酸探針在變性后與已變性的靶核酸在退火溫度下復(fù)性；通過熒光顯微鏡觀察熒光信號可在不改變被分析對象（即維持其原位）的前提下對靶核酸進(jìn)行分析。DNA熒光標(biāo)記探針是其中最常用的一類核酸探針。利用此探針可對組織、細(xì)胞或染色體中的DNA進(jìn)行染色體及基因水平的分析。熒光標(biāo)記探針不對環(huán)境構(gòu)成污染，靈敏度能得到保障，可進(jìn)行多色觀察分析，因而可同時使用多個探針，縮短因單個探針分開使用導(dǎo)致的周期過程和技術(shù)障礙。