文庫構(gòu)建-cDNA文庫
2019年6月28日
一條評論
cDNA 文庫(cDNA library ): 是指某種生物基因組轉(zhuǎn)錄的全部mRNA經(jīng)反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的cDNA片段分別與克隆載體（常用噬菌體或質(zhì)粒載體）重組，并將其引入到相應的宿主細胞中（一般為E.coli.）繁殖和擴增，則每個細菌含有一段cDNA，
cDNA 文庫(cDNA library ): 是指某種生物基因組轉(zhuǎn)錄的全部mRNA經(jīng)反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的cDNA片段分別與克隆載體（常用噬菌體或質(zhì)粒載體）重組，并將其引入到相應的宿主細胞中（一般為E.coli.）繁殖和擴增，則每個細菌含有一段cDNA，
gDNA文庫即基因組DNA（genomic DNA）文庫，又稱基因組文庫（Genomic Library），把某種生物基因組的全部遺傳信息通過克隆載體貯存在一個受體菌克隆子群體中，這個群體即為這種生物的基因組文庫。
拷貝數(shù)變異(Copy number variation, CNV)是由基因組發(fā)生重排而導致的, 一般指長度為1 kb 以上的基因組大片段的拷貝數(shù)增加或者減少, 主要表現(xiàn)為亞顯微水平的缺失和重復。CNV 是基因組結(jié)構(gòu)變異(Structuralvariation, SV) 的重要組成部分。
全基因合成 (Gene synthesis)，也稱基因合成，即基因人工合成,是重要的基因獲取手段之一，是指利用生物化學的方法將人工合成的寡核苷酸拼接成基因的一種技術(shù)。
TA克隆(TA cloing)是一種將PCR產(chǎn)物直接連接到T克隆載體的方法。TA克隆技術(shù)是利用了Taq聚合酶具有末端轉(zhuǎn)移酶（TdT）活性，但卻不具有3’-5’端外切酶校準活性的特點，可在PCR產(chǎn)物的3’末端加上一個非模板依賴的dA。
染色體步移(Chromosome walking)，又稱為基因組步移（Genome walking），是指由生物基因組或基因組文庫中的已知序列出發(fā)，逐步探知其旁鄰的未知序列或與已知序列呈線性關(guān)系的目標序列的方法。
核酸是指DNA和RNA，高質(zhì)量的核酸是所有分子生物學實驗的基礎。核酸提取服務可以快速地從動植物組織、細菌、真菌、細胞中提出高質(zhì)量的DNA或RNA，以用于PCR、分子標記、基因雜交等各種科學研究。
生物信息學（Bioinformatics）是一門交叉科學，它包含了生物信息的獲取、加工、存儲、分配、分析、解釋等在內(nèi)的所有方面，它綜合運用數(shù)學、計算機科學和生物學的各種工具，來闡明和理解大量生物數(shù)據(jù)所包含的生物學意義。
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（Single cell RNA sequencing），是在單個細胞水平對mRNA進行高通量測序的一項新技術(shù)，針對單個細胞研究其整體水平的基因表達情況，成功解決細胞分子機制研究中常見的細胞異質(zhì)性、細胞量少而無法進行常規(guī)高通量測序等難題。
細胞全基因組測序技術(shù)是在單細胞水平對全基因組進行擴增與測序的一項新技術(shù)。其原理是將分離的單個細胞的微量全基因組DNA進行擴增，獲得高覆蓋率的完整的基因組之后通過外顯子捕獲進而高通量測序用于揭示細胞群體差異和細胞進化關(guān)系。
特定代謝物含量檢測屬于靶向代謝組學分析。代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（MW<1500）。其樣品主要是血漿或者血清、尿液、唾液、以及細胞和組織的提取液，以及細胞和組織的提取液。
脂類化合物通常被定義為自然界中存在的一類難溶于水、易溶于有機溶劑的小分子化合物，是生物體內(nèi)非常重要的物質(zhì)。脂類化合物與細胞凋亡、信號傳導、疾病感染、免疫功能，以及胎兒代謝缺陷都密切相關(guān)，脂類化合物的代謝還與糖尿病、肝癌、腎病、乳腺癌密切相關(guān)。
靶向代謝組學（Targeted Metabolomics）是代謝組學研究的重要組成部分，也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言，靶向代謝組分析具有特異性強，檢測靈敏度高和定量準確等幾個特點。
全代謝組學，又稱代謝全譜或非靶向代謝組學分析，采用色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)采集樣品的代謝譜圖，比較不同組樣品代謝產(chǎn)物的含量，鑒定差異表達的代謝物，并探索差異代謝物之間的代謝通路。
免疫組庫（Immune Repertoire，IR）是指在任何指定時間，某個個體的循環(huán)系統(tǒng)中所有功能多樣性B細胞和T細胞的總和。免疫組庫測序（Immune Repertoire sequencing(IR-SEQ)）是以 T/B 淋巴細胞為研究目標
組蛋白質(zhì)組學聯(lián)合分析，在目前各種類型的組學中，核酸組學(主要是基因組學和轉(zhuǎn)錄組學)告訴我們可能發(fā)生什么（發(fā)掘生命現(xiàn)象的底層原因），蛋白組學告訴我們將要發(fā)生什么（發(fā)掘生命現(xiàn)象的表層原因）
蛋白質(zhì)組與轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析，轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學都是獲得基因表達情況的重要工具，從生物學角度上看，轉(zhuǎn)錄組代表了基因表達的中間狀態(tài)，可以反映諸如轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的機理；
轉(zhuǎn)錄組學和代謝組學整合分析，是指對來自轉(zhuǎn)錄組和代謝組的批量數(shù)據(jù)進行歸一化處理及統(tǒng)計學分析，建立不同層次分子間數(shù)據(jù)關(guān)系；同時結(jié)合功能分析
通過對不同層面的表達水平分析，實現(xiàn)對蛋白質(zhì)及代謝物的全譜分析。蛋白組是某種生物所能表達的所有蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)是生命功能的執(zhí)行者，其含量的變化在生物體的生長、環(huán)境應激、疾病發(fā)生發(fā)展等過程中發(fā)揮著重要的作用，是生命活動執(zhí)行者。
組學主要包括基因組學（Genomics）、轉(zhuǎn)錄組學（Transcriptomics）、蛋白質(zhì)組學（Proteomics）和代謝組學（Metabolomics），高通量組學方法的應用產(chǎn)生了大量基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和代謝組等組學數(shù)據(jù)。