細菌基因組測序,三代測序和二代哪個更好一些?
想測一株菌的完成圖,基因組大概3Mb,GC含量46%
測序公司說可以用二代HiSeq先測,然后用一代、三代補Gap;
或者用二代測完精細圖,自己補Gap。價格便宜但是時間耗費要長一些。
最近看了一些資料,三代讀長更長,測完拼裝,不用補Gap的樣子。覆蓋度也能達到100×,“感覺”好像更好一些。
如果價格差不多的情況下,三代和二代哪個更適合用來測細菌完成圖呢。
請各位大神賜教~~
想測一株菌的完成圖,基因組大概3Mb,GC含量46%
測序公司說可以用二代HiSeq先測,然后用一代、三代補Gap;
或者用二代測完精細圖,自己補Gap。價格便宜但是時間耗費要長一些。
最近看了一些資料,三代讀長更長,測完拼裝,不用補Gap的樣子。覆蓋度也能達到100×,“感覺”好像更好一些。
如果價格差不多的情況下,三代和二代哪個更適合用來測細菌完成圖呢。
請各位大神賜教~~
要發(fā)表評論,您必須先登錄。