去垢劑的選擇
摘要
本文綜述了實驗室去垢劑及其在生物醫(yī)學實驗中的應(yīng)用。本文綜述了離子型、非離子型和兩性離子型去垢劑及其一般性能,以及各組常用去垢劑的相關(guān)信息。最后,我們對一些常用去垢劑的實驗室調(diào)查結(jié)果進行了簡要討論。
介紹
生物醫(yī)學實驗室使用的去垢劑是溫和的表面活性劑(表面作用劑),用于細胞溶解(即細胞膜破裂)和釋放細胞內(nèi)材料。它們是兩親性分子,同時含有親水和疏水區(qū)域。這種兩親性使得去垢劑能夠破壞蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)脂質(zhì)和脂質(zhì)的結(jié)合、變性蛋白質(zhì)和其他大分子,并防止免疫化學分析和蛋白質(zhì)結(jié)晶中的非特異性結(jié)合。
實驗室研究中使用的去垢劑有很多種。新的兩親性化合物,通常設(shè)計用于特定用途,繼續(xù)開發(fā)(例如,麥芽糖新戊二醇[1]和糖基取代的二羧酸鹽[2])。本文綜述了最常用的實驗室去垢劑的特點和應(yīng)用。
Table 1. Classification of detergents.
Type | Chemicals |
ionic | sodium dodecyl sulfate (SDS), deoxycholate, cholate, sarkosyl |
non-ionic | Triton X-100, DDM, digitonin, tween 20, tween 80 |
zwitterionic | CHAPS |
chaotropic | urea |
去垢劑是兩親性有機化合物,由疏水性非極性碳氫化合物部分(尾部)和親水性極性基團(圖1a)組成。這種分子結(jié)構(gòu)與構(gòu)成細胞膜的兩親性磷脂非常相似,只是磷脂具有一對附著于親水性基團的疏水尾(圖1d)。當在適當濃度和溫度下溶解于水中時,兩親性分子自組裝成結(jié)構(gòu),使它們的親水性頭組保持在外部,疏水性尾部保持在內(nèi)部遠離水。由于它們的分子差異,去垢劑分子形成球形膠束(圖1c),而磷脂更有可能形成雙層(圖1d)。分子結(jié)構(gòu)的相似性使得去垢劑能夠穿透磷脂雙層膜,從而破壞細胞膜。
此外,膠束的疏水核心可以結(jié)合到蛋白質(zhì)的疏水區(qū)域(圖1b)。膠束中去垢劑分子的數(shù)量稱為聚集數(shù),這是一個用來評估膜蛋白溶解性的重要參數(shù)[3]。疏水區(qū)的長度與疏水性程度成正比,在去垢劑中是相當恒定的,而帶電的頭組是可變的。溫度和濃度是去垢劑相分離和溶解度的重要參數(shù)。在給定溫度下觀察膠束的最小去垢劑濃度稱為臨界膠束濃度(CMC)。在低于CMC的任何濃度下,只觀察到單體;在高于CMC的濃度下,膠束和單體與其他不溶于水的非膠束相共存。同樣,形成膠束的最低溫度稱為臨界膠束溫度(CMT)。CMC也受人頭組親脂性程度的影響。一般來說,低親脂性或脂恐怖性會導致高CMC。
普通去垢劑根據(jù)其特性分為三類:離子型(陰離子型或陽離子型)、非離子型和兩性離子型。下面我將討論這些類別中的常用去垢劑,并提供有關(guān)實驗室去垢劑的選擇和使用的重要信息。
一個好的去垢劑應(yīng)該能夠溶解細胞,溶解蛋白質(zhì),并適合你的下游應(yīng)用。此外,還應(yīng)考慮天然或變性形式的可溶性蛋白質(zhì)。沒有適用于所有應(yīng)用的理想去垢劑,即使在同一應(yīng)用中,結(jié)果也各不相同(表3)。因此,在考慮了各種選擇后,往往需要反復試驗才能找到最佳的去垢劑,而去垢劑的混合物可能是最佳的。此外,去垢劑工作液的新鮮制備通常是避免水解和氧化的最佳實踐。
Table 3. Properties and main applications of common detergents
Detergent | MW (Da) monomer | MW (Da) micelle | CMC (mM) 25oC | Aggregation No. | Cloud Point (oC) | Avg. Micellar Weight | Strength | Dialyzable | Applications |
SDS | 289 | 18,000 | 7-10 | 62 | >100 | 18,000 | Harsh | Yes | Cell lysis, Electrophoresis, WB, hybridization |
Triton X-100 | 625 | 90,000 | 0.2-0.9 | 100-155 | 65 | 80,000 | Mild | No | Enzyme immunoassays, IP, Membrane solubilization |
CHAPS | 615 | 6,150 | 6 | 10 | >100 | 6,150 | Mild | Yes | IEF, IP |
NP-40 | 680 | 90,000 | 0.059 | 45-50 | Mild | No | IEF | ||
n-dodecyl-β-D-maltoside | 511 | 0.15 | 98 | 50,000 | Protein Crystallization | ||||
Tween-20 | 1228 | 0.06 | 76 | Mild | No | WB, ELISA, Enzyme immunoassays | |||
Digitonin | 1229 | 70,000 | <0.5 | 60 | 70,000 | Mild | No | Membrane solubilization |