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去垢劑的選擇

摘要

本文綜述了實驗室去垢劑及其在生物醫(yī)學實驗中的應(yīng)用。本文綜述了離子型、非離子型和兩性離子型去垢劑及其一般性能,以及各組常用去垢劑的相關(guān)信息。最后,我們對一些常用去垢劑的實驗室調(diào)查結(jié)果進行了簡要討論。

 

介紹

生物醫(yī)學實驗室使用的去垢劑是溫和的表面活性劑(表面作用劑),用于細胞溶解(即細胞膜破裂)和釋放細胞內(nèi)材料。它們是兩親性分子,同時含有親水和疏水區(qū)域。這種兩親性使得去垢劑能夠破壞蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)脂質(zhì)和脂質(zhì)的結(jié)合、變性蛋白質(zhì)和其他大分子,并防止免疫化學分析和蛋白質(zhì)結(jié)晶中的非特異性結(jié)合。

實驗室研究中使用的去垢劑有很多種。新的兩親性化合物,通常設(shè)計用于特定用途,繼續(xù)開發(fā)(例如,麥芽糖新戊二醇[1]和糖基取代的二羧酸鹽[2])。本文綜述了最常用的實驗室去垢劑的特點和應(yīng)用。

Table 1. Classification of detergents.

Type Chemicals
ionic sodium dodecyl sulfate (SDS), deoxycholate, cholate, sarkosyl
non-ionic Triton X-100, DDM, digitonin, tween 20, tween 80
zwitterionic CHAPS
chaotropic urea

去垢劑是兩親性有機化合物,由疏水性非極性碳氫化合物部分(尾部)和親水性極性基團(圖1a)組成。這種分子結(jié)構(gòu)與構(gòu)成細胞膜的兩親性磷脂非常相似,只是磷脂具有一對附著于親水性基團的疏水尾(圖1d)。當在適當濃度和溫度下溶解于水中時,兩親性分子自組裝成結(jié)構(gòu),使它們的親水性頭組保持在外部,疏水性尾部保持在內(nèi)部遠離水。由于它們的分子差異,去垢劑分子形成球形膠束(圖1c),而磷脂更有可能形成雙層(圖1d)。分子結(jié)構(gòu)的相似性使得去垢劑能夠穿透磷脂雙層膜,從而破壞細胞膜。

此外,膠束的疏水核心可以結(jié)合到蛋白質(zhì)的疏水區(qū)域(圖1b)。膠束中去垢劑分子的數(shù)量稱為聚集數(shù),這是一個用來評估膜蛋白溶解性的重要參數(shù)[3]。疏水區(qū)的長度與疏水性程度成正比,在去垢劑中是相當恒定的,而帶電的頭組是可變的。溫度和濃度是去垢劑相分離和溶解度的重要參數(shù)。在給定溫度下觀察膠束的最小去垢劑濃度稱為臨界膠束濃度(CMC)。在低于CMC的任何濃度下,只觀察到單體;在高于CMC的濃度下,膠束和單體與其他不溶于水的非膠束相共存。同樣,形成膠束的最低溫度稱為臨界膠束溫度(CMT)。CMC也受人頭組親脂性程度的影響。一般來說,低親脂性或脂恐怖性會導致高CMC。

普通去垢劑根據(jù)其特性分為三類:離子型(陰離子型或陽離子型)、非離子型和兩性離子型。下面我將討論這些類別中的常用去垢劑,并提供有關(guān)實驗室去垢劑的選擇和使用的重要信息。

一個好的去垢劑應(yīng)該能夠溶解細胞,溶解蛋白質(zhì),并適合你的下游應(yīng)用。此外,還應(yīng)考慮天然或變性形式的可溶性蛋白質(zhì)。沒有適用于所有應(yīng)用的理想去垢劑,即使在同一應(yīng)用中,結(jié)果也各不相同(表3)。因此,在考慮了各種選擇后,往往需要反復試驗才能找到最佳的去垢劑,而去垢劑的混合物可能是最佳的。此外,去垢劑工作液的新鮮制備通常是避免水解和氧化的最佳實踐。

Table 3. Properties and main applications of common detergents

Detergent MW (Da) monomer MW (Da) micelle CMC (mM) 25oC Aggregation No. Cloud Point (oC) Avg. Micellar Weight Strength Dialyzable Applications
SDS 289 18,000 7-10 62 >100 18,000 Harsh Yes Cell lysis, Electrophoresis, WB, hybridization
Triton X-100 625 90,000 0.2-0.9 100-155 65 80,000 Mild No Enzyme immunoassays, IP, Membrane solubilization
CHAPS 615 6,150 6 10 >100 6,150 Mild Yes IEF, IP
NP-40 680 90,000 0.059 45-50 Mild No IEF
n-dodecyl-β-D-maltoside 511 0.15 98 50,000 Protein Crystallization
Tween-20 1228 0.06 76 Mild No WB, ELISA, Enzyme immunoassays
Digitonin 1229 70,000 <0.5 60 70,000 Mild No Membrane solubilization

 

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